Rooney treenerikarjäär algas 2020. aasta novembris, kui tema hoolde usaldati Mart Poomi endine koduklubi Derby County. Toona esiliigas mänginud Derbys oli Rooney töö rahuldav. Esimesel hooajal jäi ta vaatamata keerulisele tabeliseisule liigasse püsima.
Hooajal 2021-22 lõppes küll tugevuselt kolmandasse liigasse (League One) pudenemisega, ent selles polnud peamine süüdlane Rooney, vaid klubile finantsrikkumiste tõttu määratud 21 miinuspunkti. Ilma selle karistuseta lõpetanuks Derby hooaja tabeli keskel.