Mohajer-6 droonid on loodud luure-, järelevalve-, sihtmärkide kogumise ja tuvastamise (ISTAR) missioonideks. Samuti on need droonid võimelised sooritama õhust rünnakuid maapealsete sihtmärkide vastu juhitava laskemoonaga.
Luurearuanne toob välja intsidendid, kus Ukraina lasi 23. septembril 2022 edukalt alla Mohajer-6 drooni Musta mere kohal, ning juhtumi, kus Venemaa väed tulistasid ekslikult maha ühe oma drooni Krimmi kohal 6. juunil 2023. aastal.